Gli ambientalisti temono che i progetti di desalinizzazione dell’acqua di mare possano avere impatti negativi sulla pesca locale e sugli ecosistemi marini. Gli impianti di desalinizzazione dell’acqua di mare possono inalare la vita marina, in particolare larve di pesci, causando danni alle risorse ittiche. Inoltre, le acque reflue e salate possono essere scaricate durante il processo di desalinizzazione dell'acqua di mare, causando inquinamento e disturbo all'ecosistema marino.

Questo articolo analizza la struttura dei costi del processo di desalinizzazione, inclusi tecnologia, energia, scala e altri aspetti. Sebbene i costi attuali siano relativamente elevati, i progressi nell’innovazione tecnologica, nelle economie di scala e nella gestione della manutenzione ridurranno gradualmente i costi.