1. Dipendenza energetica 2. Elevato costo di investimento iniziale 3. Incrostazione e corrosione della membrana 4. Il costo di produzione dell’acqua dei sistemi di desalinizzazione solare potrebbe essere più elevato 5. L'impianto di desalinizzazione solare può avere un certo impatto sulle risorse idriche locali